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近年来,随着宏基因组学研究的兴起及16S核糖体RNA基因测序技术的发展,食管微生态的研究已经成为一个新兴的研究领域,并取得了一定进展。食管中的定植菌对维持正常食管的功能发挥了重要作用,但在某些影响因素的干扰下,食管正常定植菌群会发生改变。这些食管菌群的改变可直接或间接与食管疾病的发生发展有关,食管疾病进展中常伴随食管菌群的改变。本文总结了正常食管、食管腺癌、食管鳞状细胞癌的食管菌群特征,证实某些微生物的存在可能作为食管癌早期筛查的标志物和治疗靶点,为研究食管癌的治疗策略提供了新思路。本文还总结了食管微生态