基于转录组学分析探究半夏白术天麻汤撤药治疗的氨基酸代谢特征

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该研究基于转录组学分析方法,结合氯化锂-匹罗卡品诱导的癫痫大鼠模型,明确半夏白术天麻汤撤药治疗方案的有效性,探究半夏白术天麻汤撤药治疗与氨基酸代谢的关系。构建氯化锂-匹罗卡品构建癫痫大鼠模型,设置对照组(control group, Ctrl)、模型组(epilepsy group, Ep)、中西药结合治疗组(Banxia Baizhu Tianma Decoction & antiepileptic drug integrative group, BADIG)、撤药治疗组(antiepileptic drug withdrawal group, ADWG)。Ctrl组和Ep组以超纯水灌胃12周;BADIG组灌胃半夏白术天麻汤浸膏和卡马西平溶液12周;ADWG组前6周灌胃半夏白术天麻汤浸膏和卡马西平溶液,后6周仅灌胃半夏白术天麻汤浸膏。通过大鼠行为学、脑电图和神经元细胞病理变化评估疗效。高通量测序获取海马组织中氨基酸代谢相关差异基因,采用qRT-PCR验证各组海马组织中mRNA的表达,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络筛选核心基因,并对其进行基因本体(Gene Ontology, GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。针对ADWG vs BADIG构建分别构建circRNA-miRNA-mRNA和lncRNA-miRNA-mRNA 2组ceRNA网络。结果显示,与Ep组比较,ADWG组大鼠在行为学、脑电图以及神经元病理形态学上均得到显著改善。转录组学分析共筛选出34个氨基酸代谢相关基因,并通过qRT-PCR实验对测序结果进行验证,构建PPI网络获取8个核心基因,涉及多条氨基酸代谢相关生物学过程、分子功能以及信号通路。根据氨基酸代谢相关基因,在ADWG vs BADIG中构建了由17个circRNA、5个miRNA和2个mRNA构成的circRNA-miRNA-mRNA三元转录网络,以及由10个lncRNA、5个miRNA和2个mRNA构成的lncRNA-miRNA-mRNA三元转录网络。综上所述,半夏白术天麻汤能有效实现抗癫痫药物的撤药,其机制可能与氨基酸代谢的转录组学调控有关。
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