【摘 要】
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目的通过生物信息学方法分析脊髓损伤后肌肉萎缩患者肌肉组织的差异表达基因,筛选出与该病相关基因。方法选取基因表达数据库(GEO)中GSE21497芯片,通过R语言软件筛选出差异基
【机 构】
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福建中医药大学中西医结合学院,福建省立医院神经外科
【基金项目】
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福建省科技计划重点项目(2016Y0017)
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目的通过生物信息学方法分析脊髓损伤后肌肉萎缩患者肌肉组织的差异表达基因,筛选出与该病相关基因。方法选取基因表达数据库(GEO)中GSE21497芯片,通过R语言软件筛选出差异基因。将筛选出的差异表达基因进行GO、KEGG分析,构建蛋白质互作用网络。使用分子复合物检测算法(MCODE)筛选相互作用紧密的显著差异表达基因。结果筛选得出294个差异表达基因,其中8个上调表达基因,286个下调表达基因。GO富集分析中,差异基因主要存在于肌质、肌膜、肌球蛋白复合物等结构,主要涉及肌肉构成和β-连环蛋白、热休克蛋白等
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