利用高通量测序技术分析鱼菜共生池塘的真菌多样性和群落结构

来源 :中国海洋大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：belive

【摘要】

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本文采集了位于新疆水生野生动物救护中心和乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地的鱼菜共生池塘水样及水培空心菜根系,基于Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对上述样本

【作者】

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孟玮高攀翟旭亮胡建勇杨天燕李晓东时春明

【机构】

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浙江省海洋水产研究所,新疆维吾尔自治区水产科学研究所,重庆市水产技术推广总站,乌鲁木齐市百汇鱼生渔业科技有限公司,浙江海洋大学水产学院

【出处】

：

中国海洋大学学报:自然科学版

【发表日期】

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2021年3期

【关键词】

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鱼菜共生新疆高通量测序真菌多样性群落结构 aquaponics Xinjiang high-throughput sequencing fungus d

【基金项目】

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新疆维吾尔自治区科技支疆项目(2019E0263),新疆维吾尔自治区创新环境(人才、基地)建设专项(自然科学基金项目)(2020D01A103),现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-45)资助

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本文采集了位于新疆水生野生动物救护中心和乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地的鱼菜共生池塘水样及水培空心菜根系,基于Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对上述样本的宏基因组ITS基因序列进行了测定和分析。在6份样品(4份水体样品、2份根系样品)中,共检测到78348条平均长度为256 bp的有效序列,这些真菌包括了6个门、25个纲和72个目。不同地点、不同样品类型间的真菌微生物群落存在明显差异,隶属于子囊菌门(Ascomycota)锤舌菌纲(Leotiomycetes)白粉菌目(Erys

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