从2009年9月1日开始，国家质检总局将开始对食品包装用纸制品进行无证查处。未获得生产许可证的厂家，不得生产、销售各种与食品接触的纸制品。这将有效保证食品包装用纸制品的安全。
　　目前，一些纸杯生产厂家为了减少成本，竟然用回收来的废弃纸张进行生产。为了增加纸杯的重量，他们往废纸里添加一些工业用的碳酸钙、滑石粉，而这些物质中含有较多的重金属，对人体危害极大。有的纸杯厂家在使用废纸生产之后，因为纸浆质量不过关，又要让杯子看上去更白，就加人大量的荧光增白剂。如果将这种纸杯放在荧光灯下，会呈现出蓝色。根据医学临床实验，荧光物质一旦进入人体，可以使细胞产生变异，成为潜在的致癌因素。
　　从专业角度来讲，人们普遍使用的纸杯应该被称为“纸塑杯”。这种纸杯的外壁是一层纸，内壁则是一层淋膜纸，即表面涂抹了一层聚乙烯膜以防水、防油。聚乙烯本身是无毒、无味的，属于比较安全的化学物质，因此被普遍用于食品包装中。
　　选用原生的、标准的聚乙烯，是安全的，对人体无害。但是，如果选用纯度较低的工业用聚乙烯或者废塑料，或者加工工艺不过关，那么在高温和重金属的作用下，就会产生羰基化合物。羰基化合物的分子较大，常温下不易挥发，一旦往纸杯里倒入热水，就会挥发出来。这时，会闻到一股怪味。令人担心的是，由于目前市场上不合格的产品太多了，以至于大家以为纸杯有味道是正常。事实上，虽然这种羰基化合物究竟会给人体带来怎样的危害，目前还没有相关研究证实，但从一般理论上分析，长期摄入这种有机化合物，对人体一定是有害的。事实上，纸杯质量不合格，很大程度上还在于纸杯厂家违规生产聚乙烯膜。这些废弃的聚乙烯，来源复杂。有的来自医疗垃圾，有的来自装过农药、油漆涂料、砒霜等有害物质的包装物。
　　专家建议，一次性纸杯能不用就不用，除了质量问题，从节约资源、保护环境的角度讲也应该尽量少用、甚至不用。购买一次性纸杯时，最好“一闻二摸三看”，如果闻起来有刺鼻的气味，或者摸着杯子感觉是软软的，或者对着光看有杂质，最好不要购买。使用一次性纸杯时，第一杯水最好不要喝，先拿开水烫一下，过了四、五分钟将水倒掉，让纸杯中有害物质充分挥发。