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由于T细胞抗原受体(TCR)形成中的随机重排的特性,所以其不但产生对非己的外来抗原的,也产生对自己的自身成分的TCR.在胸腺中T细胞成熟过程要经历阳性选择,还要接受一系列阴性选择,包括克隆清除,克隆编辑,克隆无能或忽视,以达到维持自身免疫耐受.为确保进入外周的自身反应性T细胞维持耐受,具有调节功能的T细胞亚群发挥重要作用,如:CD25+CD4+调节性T细胞(Tr),CD8aa+IEL和Val4iNK-T细胞等,一些细胞因子如IL-10和TGF-β等也参与调节性T细胞的机制。