乙型肝炎病毒基因型(A-F)多引物PCR分型法的初步建立

来源 :中华肝脏病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jtgdz
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目的 建立一种简便易行的乙型肝炎病毒基因型分型方法(只需 PCR)。方法 对 GenBank中查获的114例HBV全序列进行比较分析,找出每种基因型相对于其他5种基因型的独特序列,并根据这些独特序列设计出6对分别针对A-F基因型的特异引物。用这6对引物分别对标本进行PCR,根据阳性结果判断出标本的基因型。进一步简化该方法,用多引物对PCR法(PCR with several primer sets in a single tube,Multiplex PCR)将B、C、D 3种基因型的特异引物混台进行PCR,根据扩增片断的大小判断基因型。用此方祛对已鉴定的B、C、D型标本进行比较和验证。结果 单引物对PCR与多引物对PCR的分型结果一致,且与以前用PCR-RFLP法的分型结果一致。结论 用多引物对PCR分型法准确易行,灵敏性高,便于推广应用。 Objective To establish a simple and convenient typing method of hepatitis B virus genotype (only PCR). Methods A total of 114 HBV isolates were detected in GenBank. The unique sequences of each HBV genotype were compared with those of the other 5 genotypes. Based on these unique sequences, 6 pairs of genotypes with specific A-F genotypes were designed Primer. The six pairs of primers were used to perform PCR on the specimens, and the genotypes of the specimens were determined based on the positive results. The method was further simplified, and specific primers of B, C and D genotypes were mixed by PCR with several primer sets in a single tube (PCR). According to the size of the amplified fragment genotype. Use this side cured cured B, C, D specimens have been compared and verified. Results The results of single-primer PCR and multi-primer PCR were consistent with the results of PCR-RFLP. Conclusion The multi-primer PCR method is accurate, sensitive and easy to popularize.
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