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序列搜索算法由三部分组成：搜索过程、搜索得到多肽的各氨基酸残基的评分两端（Ｎ端、Ｃ端）搜索得到的多肽的合并过程，通过若干实际多肽质谱的解析，结果表明，该算法对多种序列专一性离子并存的未知多肽质谱的解析，可获得较满意结果，尤其是它的评分方式及标准，比较适合多肽质谱图的实际情况，可最大限度地判断解析结果的准确度，为从事用质谱测定多肽一级结构的分析工作者提供了一比较简便且可靠的手段，也为谱法快速测定蛋白