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基于预训练语言模型（LM）和知识图谱（KG）的联合推理在生物医学领域应用时,因其专业术语表示方式多样、语义歧义以及知识图谱存在大量噪声等问题,联合推理模型并未取得较好的效果。基于此,提出一种面向生物医学领域的可解释推理方法 DF-GNN,该方法统一了文本和知识图谱的实体表示方式,利用大型生物医学知识库构造子图并进行去噪,改进文本和子图实体的信息交互方式,增加对应文本和子图节点的直接交互,使得两个模态的信息能够深度融合。同时,利用知识图谱的路径信息对模型推理过程提供可解释性。在公开数据集MedQA-USMLE和MedMCQA上的测试结果表明,与现有的生物医学领域联合推理模型相比, DF-GNN可以更可靠地利用结构化知识进行推理并提供解释性。