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利用1997—2009年中国30个省（自治区、直辖市）的面板数据，采用GMM的分析方法，比较分析了四大融资渠道——自有资金、政府资金、金融机构贷款以及外商直接投资对全国及三大地区自主创新能力的影响。研究结果表明：从全国来看，自有资金对全国自主创新能力提升的支持作用最大；金融机构贷款主要支持实用新型专利的生产；政府资金主要支持发明专利的生产；FDI对我国自主创新能力提升的促进作用较小；金融机构贷款对东部地区自主创新的促进作用最显著；中、西部地区的自主创新更依赖于自有资金和政府资金。