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MDRV P10基因的克隆、分析及蛋白质结构预测

来源 :福建农林大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：high

【摘要】

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参考Gen Bank中番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)S4基因序列,设计合成一对非结构蛋白P10基因的特异性引物,以MDRV-YB株病毒RNA为模板进行RT-PCR扩增,并将目的基因克隆到PGEM-T载体,提取质粒测序.对测序结果进行遗传进化树分析和生物信息学软件预测、分析蛋白质结构和功能.结果表明,MDRV-YB株病毒的P10蛋白基因开放阅读框(ORF)全长

【作者】

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蔡一龙庄育彬周五朵王全溪邱晓东吴宝成

【机构】

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福建农林大学动物科学学院

【出处】

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福建农林大学学报(自然科学版)

【发表日期】

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2015年06期

【关键词】

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番鸭呼肠孤病毒 P10 基因克隆蛋白质预测与分析 muscovy duck reovirus non-structural protein P10 gen

【基金项目】

：

国家自然科学基金-促进海峡两岸科技合作联合基金项目（U1305212）, 福建省自然科学基金项目（2013J0169）

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参考Gen Bank中番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)S4基因序列,设计合成一对非结构蛋白P10基因的特异性引物,以MDRV-YB株病毒RNA为模板进行RT-PCR扩增,并将目的基因克隆到PGEM-T载体,提取质粒测序.对测序结果进行遗传进化树分析和生物信息学软件预测、分析蛋白质结构和功能.结果表明,MDRV-YB株病毒的P10蛋白基因开放阅读框(ORF)全长为288 bp,编码95个氨基酸.核苷酸比对结果表明,与标准株法国MDRV-89026株同源性为95%,

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