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马毛色是品种鉴定和个体识别的重要依据。马KIT基因位于3号染色体，KIT基因突变影响马毛色及毛色的分布。对德保矮马和哈萨克马69个个体的KIT基因21个外显子及部分内含子直接测序，共发现了5个SNPs，其中1个位于5＇-UTR区（g．91214T〉G），1个位于内含子20（g．171356C〉G），另外3个分别位于外显子15、20和21（g．164297C〉T；g．170189C〉T；g．171471G〉A，P．Ala960Thr）。用PCR—RFLP方法对69个个体进行分型，发现外显子15有3种基因型T