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为筛选得到何首乌（Fallopia multiflora）种特异DNA探针，通过何首乌gDNA和其近缘植物毛脉蓼（Fmultiflora var．cillinerve）gDNA之间的的抑制消减杂交（Suppression subtraction hybridization，SSH）得到何首乌的差减片段，再将标记的差减片段和多物种gDNA阵列杂交筛选得到了4条何首乌DNA探针，探针通过反向斑点杂交检测，能很好地区分何首乌及其混伪品。获得的探针在中药鉴定基因芯片的制备及何首乌种质和生药鉴定方面具应用前景。