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向日葵产业的发展对调整黑龙江省种植业结构、利用中低产田、增加农民收入具有十分重要的作用，为了推广ISSR分子标记技术在向日葵分子育种上的应用，利用正交设计对向日葵ISSR_PCR反应体系中的5个因素（模板DNA、dNTP浓度、Mg^2＋浓度、引物浓度、Taq酶用量）在4个水平上进行优化，确立了适合向日葵ISSR-PCR反应的20μL体系：50ng模板DNA、2．0μmol·L^-1 dNTP、37．5μmol·L^-1Mg^2＋、8μmol·L^-1引物、8UDNATaq酶。