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提出了一种基于特征频率序列经多重组合方式判定的小电流接地系统单相接地故障区段定位方法。该方法对一条馈线上各检测点的暂态零模电流纯故障分量经S变换，以暂态能量最大时对应的频率点为基准，选取出特征频率序列。将一整条馈线作为系统，求取出任意相邻两检测点的暂态零模电流能量相对熵值。采用多重组合方式对求取的的熵值进行比较，待所有组合方式比较完毕后，将出现次数最多的“可能故障区段”判定为故障区段。采用相对熵值衡量波形的差异性，特征效果明显；运用多重组合方式进行判定，可提高定位结果的可信度。