【摘 要】
:
经过特殊设计的小分子抑制剂可共价结合KRas蛋白的催化结构域,从而抑制KRas与下游效应蛋白的结合.本研究采用镍柱亲和层析、酶切标签、凝胶过滤层析等步骤制备了高纯度的KRas催化结构域(氨基酸残基1-169)蛋白;等温滴定量热(ITC)实验证明了KRas蛋白通过K42残基与小分子抑制剂ZCL1688进行结合;通过分子对接得到KRas蛋白与ZCL1688的复合物的建模结构,发现两者的结合对KRas与下游蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶RAF的结合有明显竞争作用.本研究建立了一种简便的KRas蛋白催化结构域(氨基酸残基
【机 构】
:
上海交通大学生命科学技术学院,上海200240
论文部分内容阅读
经过特殊设计的小分子抑制剂可共价结合KRas蛋白的催化结构域,从而抑制KRas与下游效应蛋白的结合.本研究采用镍柱亲和层析、酶切标签、凝胶过滤层析等步骤制备了高纯度的KRas催化结构域(氨基酸残基1-169)蛋白;等温滴定量热(ITC)实验证明了KRas蛋白通过K42残基与小分子抑制剂ZCL1688进行结合;通过分子对接得到KRas蛋白与ZCL1688的复合物的建模结构,发现两者的结合对KRas与下游蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶RAF的结合有明显竞争作用.本研究建立了一种简便的KRas蛋白催化结构域(氨基酸残基1-169)高效表达与高纯度制备方法,模拟了此蛋白与ZCL1688的结合模式,并分析了该结合模式下的相互作用,为后续筛选此蛋白与小分子抑制剂的共结晶以及复合物结构解析奠定了良好基础.
其他文献
基于Ten-eleven translocation 1(TET1)蛋白催化5-甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,5mC)生成5-羟甲基胞嘧啶(5-Hydroxymethylcytosine,5hmC),结合5hmC抗体的免疫识别反应,建立了一种电化学分析方法用于TET1蛋白的特异性检测.以金纳米颗粒(AuNPs)修饰的金电极为基体电极,通过AuNPs与探针DNA 3′端巯基之间形成的Au—S键,将探针DNA与含有5mC的互补DNA杂交形成的双链DNA自组装到电极表面.在α-酮戊二酸和Fe2+
肺癌已成为当前全球发病率和死亡率最高的癌症.早期肺癌的治愈率高,“早诊早治”已成为共识.呼出气检测具有非侵入性、取样方便且对人体友好的优势,通过对呼出气中特征代谢物的检测,寻找早期肺癌的疾病标志物,有望作为一种简单有效的早期肺癌筛查手段而备受关注.本文从临床常用肺癌筛查方法、呼出气组分及肺癌标志性挥发性有机物(VOCs)种类、呼出气VOCs收集方法、前处理方法以及肺癌标志性VOCs检测技术等方面,评述了基于呼出气VOCs检测的肺癌早期筛查技术的研究进展,并对其存在的问题和未来发展趋势进行了分析和展望.
电化学发光(ECL)是由电化学反应引发,通过一系列化学反应产生激发态发光体进而辐射发光的过程,其产生的方式主要有湮灭型电化学发光和共反应剂型电化学发光.ECL是一种表面限域的发光过程,其发光层的厚度主要由反应中间体在电极表面的分布决定.空间分辨测量能够直接测得激发态发光体、共反应剂自由基等中间体在电极表面附近的分布,进而解析ECL反应机理.该文首先简要介绍了ECL的研究进展和不同体系的反应机理,在此基础上,对空间分辨测量,包括扫描电化学显微镜、电化学发光显微成像技术和电化学发光自干涉光谱在解析ECL机理中
电子轰击电离源(Electron impact ion source,EI)是一种真空中使用的高效电离源,其电离效率可达到0.1%,几乎可以电离所有的物质.近年来,电子轰击电离源-离子阱质谱(EI-ion trap mass spectrometry,EI-ITMS)的发展使得便携式气相色谱-质谱联用仪广泛应用于有毒有害物质的快速现场定性和定量检测.然而,EI-ITMS仪器的性能调试十分繁琐.首先,EI的离子传输效率需要设置合适的透镜电压提取系统,其次,EI电离会产生大量的碎片离子,为了保证最佳的质量范围
采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法(UPLC-Orbitrap HRMS),通过对照品的保留时间、相对分子质量、二级质谱碎片和相关文献等信息对三七果中的皂苷类化合物进行了解析,以探明三七果中的皂苷类成分及其结合态糖苷类化合物构成.从三七果中共鉴定出60种三萜皂苷,包括43种原人参二醇型皂苷、3种原人参三醇型皂苷、12种C-17支链发生变化的三萜皂苷和2种齐墩果酸型皂苷,其中双丙二酰基人参皂苷Rc(Double malonyginsenoside Rc)、双丙二酰基人参皂苷Rb2(Doub
建立了一种显微三维成像技术用于定性和定量评价替罗非班(血小板膜糖蛋白(GP)Ⅱb/Ⅲa受体拮抗剂)抑制血小板黏附聚集的量效关系.在健康志愿者富血小板血浆(PRP)中加入0~50μg/mL替罗非班进行处理,将处理后的PRP分别滴加在胶原纤维蛋白和玻璃表面上,诱导血小板活化聚集,通过激光显微三维成像技术观察不同条件下血小板聚集体的显微三维形态学图像,并量化血小板聚集体的体积、面积覆盖率、血小板黏附数量和活化血小板数量比例.结果表明,利用激光显微三维成像技术可直观地观察到胶原纤维蛋白和玻璃表面形成的血小板聚集体
通过水热法合成具有钙钛矿结构的LaCo0.21Ni1.59O3,将聚多巴胺(PDA)包覆在LaCo0.21Ni1.59O3表面,得到
[email protected] Ni1.59 O3复合材料.利用钙钛矿优异的电催化性能和PDA丰富的胺基基团,将复合材料修饰在玻碳电极(GCE)表面,构建了一种新型电化学传感平台(
[email protected] Ni1.59 O3/GCE),用于重金属离子的检测.在优化条件下,LaCo0.21 Ni1.59 O3/GCE检测Cu2+、Hg2+和Pb2+的线性范围分别为0.05~10.0μ
通过简单的水热法将短碳纳米管(s-CNTs)与碘氧化铋-铋(BiOI-Bi)复合,制备了碘氧化铋-铋/短碳纳米管复合物(BiOI-Bi/s-CNTs).采用扫描电子显微镜(SEM)进行表征,结果表明,BiOI-Bi/s-CNTs由负载纳米颗粒的s-CNTs和大量微球组成.瞬时光电流测量结果表明,BiOI-Bi/s-CNTs具有优良的光电化学(PEC)性能.以BiOI-Bi/s-CNTs为光电阴极,K3[Fe(CN)6]为光电子受体,构建了一种用于检测毒死蜱(CPF)的阴极PEC方法.由于CPF被螯合富集于
建立了一种利用气相色谱(GC)检测1,3-环戊二酮化合物去对称对映选择性还原反应转化率和产物含量的方法,作为一种重要辅助手段,用于磷中心手性膦酰胺催化环状1,3-二酮类化合物的去对称对映选择性还原反应机理的研究.样品经DB-WAX色谱柱(30 m×0.25 mm,0.25μm)分离,以标准化合物比对的方法,采用GC进行定性及定量分析,可简便、快速、准确测定在不同反应时间剩余原料和生成的不同产物的量.采用本方法对无添加剂和催化剂、只加入添加剂、只加入催化剂以及同时加入添加剂和催化剂4种情况下的反应进程进行了
人乳寡糖(Human milk oligosaccharides,HMOs)与婴幼儿生命初期的生长发育密切相关,揭示其组成及结构有助于阐明HMOs功能.本研究通过超高效液相色谱-高分辨质谱联用技术,对19个HMOs(16个中性HMOs、3个酸性HMOs)进行了结构解析,在寡糖异构体裂解规律的基础上详细探讨了4组异构体的特征碎片离子,比较了3种超高效液相色谱条件下HMOs异构体分离效果的差异,为复杂HMOs异构体的结构解析及高效液相色谱条件的选择提供了科学依据.