【摘 要】
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目的 通过网络药理学、分子对接和体外实验的方法,对穿山龙治疗IgA肾病的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨.方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM获取穿山龙的主要活性成分,利用PharmMapper预测活性成分的作用靶点,并通过GeneCards、OMIM数据库检索获得疾病作用靶点.将疾病及药物预测靶点进行交集,筛选出共同的潜在治疗靶点.运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-疾病-靶点”相互作用网络图;运用STRING数据库构建蛋白相互作用的PPI
【机 构】
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中国中医科学院广安门医院,北京 100053;中国中医科学院中药研究所,北京 100700
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目的 通过网络药理学、分子对接和体外实验的方法,对穿山龙治疗IgA肾病的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨.方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM获取穿山龙的主要活性成分,利用PharmMapper预测活性成分的作用靶点,并通过GeneCards、OMIM数据库检索获得疾病作用靶点.将疾病及药物预测靶点进行交集,筛选出共同的潜在治疗靶点.运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-疾病-靶点”相互作用网络图;运用STRING数据库构建蛋白相互作用的PPI网络.运用R软件将药物-疾病共同靶点进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析,采用Autodock vina 1.1.2进行分子对接.最后,通过薯蓣皂苷干预人B淋巴细胞(DAKIKI)增殖的体外实验进行核心靶点的初步验证,采用CCK-8法检测细胞的增殖情况,运用Western blot检测Caspase 3的蛋白表达.结果 该研究筛选出穿山龙12个活性成分(其中11个活性成分涉及IgA肾病相关靶点及信号通路),涉及45个IgA肾病靶点及65条相关信号通路.网络分析结果表明穿山龙可能通过作用于ALB、CASP3、EGFR、ESR1、HSP90AA1等关键靶点及RAS等关键通路发挥治疗IgA肾病作用.分子对接提示穿山龙活性成分薯蓣皂苷元、脱氧替告皂甙元、紫杉醇、薯蓣皂苷与ALB、CASP3、EGFR、ESR1等关键靶点结合性较好,薯蓣皂苷元与HSP90AA1、CASP3、EGFR的Vina得分最低且相近.体外实验结果显示,薯蓣皂苷对LPS刺激的DAKIKI细胞增殖有一定的抑制作用,并能上调Caspase 3的蛋白水平.结论 本研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验表明,穿山龙治疗IgA肾病具有一定的效果.
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