中国近海8种石首鱼类的线粒体16S rRNA基因序列变异及其分子系统进化

来源 :自然科学进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户：tuyuantao

【摘要】

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通过PCR扩增出中国近海石首鱼科(Sciaenidae)6属8个代表种的线粒体16S rRNA基因，纯化后直接测序．利用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析，计算Kimura2-parameter遗传距离

【作者】

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蒙子宁庄志猛丁少雄金显仕苏永全唐启升

【机构】

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农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,厦门大学海洋系

【出处】

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自然科学进展

【发表日期】

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2004年5期

【关键词】

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石首鱼类线粒体 16S RRNA基因序列序列变异分子系统

【基金项目】

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国家重点基础研究发展规划(批准号:G19990437),,国家自然科学基金(批准号:30271027)资助项目

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通过PCR扩增出中国近海石首鱼科(Sciaenidae)6属8个代表种的线粒体16S rRNA基因，纯化后直接测序．利用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析，计算Kimura2-parameter遗传距离、平均核苷酸变异数、平均每位点核苷酸替代数等遗传信息指数，并结合GenBank上大斑石鲈(Pomadasys maCUzates)同源序列构建UPGMA，NJ，ME和MP系统树．结果表明，叫姑鱼(Johnius belengerii)为最早分化的一枝，其次为黄姑鱼(Nibea albiflora)和白

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