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目的
了解2012—2015年深圳市手足口病重症患儿柯萨奇A6型肠道病毒(CVA6) VP1～VP4基因特征。
方法对2012—2015年深圳市重症手足口病样本中所有CVA6阳性样本进行VP1～VP4全长序列扩增和测序，运用DNASTAR6.0和MEGA6.02软件进行系统进化分析。
结果深圳市2012—2015年共有4例重症手足口病是由CVA6病毒感染引起的，临床表现均为发热、疱疹和无菌性脑炎等中枢神经系统症状。其中2013年深圳市CVA6重症株与2012年深圳重症株核苷酸的同源性为98.8%～98.9%，氨基酸同源性为99.3%～99.8%，共有2个氨基酸突变(VP2区的G73E和VP1区的S13G)。2015年深圳市CVA6重症株与2013年重症株的核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.0%和99.3%，共发现6个氨基酸突变(分别为VP2区的E73G和VP1区的T5A、S27N、A30V、N137S和V242I)。进化分析表明，2012—2015年深圳市引起无菌性脑炎的CVA6重症株均属于D3亚型，其中深圳市2012年CVA6重症株与2012年长沙市分离株(KJ156349)进化关系最近，深圳市2013年CVA6重症株与上海市2013年CVA6分离株(KJ612513)进化关系最近，而深圳市2015年CVA6重症株与山东省2014年潍坊株(KX752785)属于同一进化分支。
结论2012—2015年引起深圳市重症手足口病的CVA6重症株均属于D3亚型，其中2015年CVA6重症株VP1区S27N、A30V的氨基酸突变位点均位于线性B细胞抗原表位区域，V242I氨基酸突变位点位于细胞受体PSGL-1结合区域，这可能会影响CVA6重症株与细胞受体的结合力及其对人群的感染力。