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加强畜牧业重大战略问题研究,是谋划现代畜牧业发展路径的重要措施。2013年,畜牧业司紧紧围绕现代畜牧业发展的关键环节,依托农业部农村经济研究中心、中国农科院农业环境与可持续发展研究所、农业经济与发展研究所和产业技术体系等单位和专家,组织开展了现代畜牧业评价指标体系、畜禽良种繁育体系扶持政策实施效果评价和畜禽养殖废弃物处理模式应用效果评价等课题研究。