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目的：研究浦东新区两区合并以来卫生总费用的分配状况及其变化趋势。方法：参考经济合作与发展组织（OECD）卫生总费用核算框架，并根据浦东新区实际情况调整指标体系，采用描述性分析和对比分析研究2009—2012年卫生总费用分配的时间序列，反映从全社会筹集到的卫生资金在各级各类卫生机构的分配使用。结果：新医改以来，浦东新区卫生总费用分配总额稳步上升；在各级医疗机构的分配中，超过70%的费用流向二、三级医院，基层医疗卫生机构费用占比由28.96%降低到22.51%；公共卫生机构费用在卫生费用分配总额中的比重明显偏