【摘 要】
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猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染仔猪可引起严重腹泻，导致肠道黏膜损伤、免疫功能低下。为探究PEDV感染仔猪空肠基因组转录水平的变化，筛选宿主免疫应答的差异表达基因，本研究收集PEDV感染仔猪的空肠组织，利用RNA-Seq技术进行转录组学测序分析。RNA-seq结果显示，与正常未感染仔猪相比，PEDV感染仔猪存在339个显著差异表达基因（DEGs），其中182个上调基因，157个下调基因。GO分子功
【基金项目】
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广西自然科学基金资助项目（2021GXNSFAA196067）； 大学生创新创业训练计划项目（202210593870）；
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猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染仔猪可引起严重腹泻，导致肠道黏膜损伤、免疫功能低下。为探究PEDV感染仔猪空肠基因组转录水平的变化，筛选宿主免疫应答的差异表达基因，本研究收集PEDV感染仔猪的空肠组织，利用RNA-Seq技术进行转录组学测序分析。RNA-seq结果显示，与正常未感染仔猪相比，PEDV感染仔猪存在339个显著差异表达基因（DEGs），其中182个上调基因，157个下调基因。GO分子功能结果显示，免疫相关差异表达基因主要与免疫球蛋白和受体结合、T细胞增殖等有关；KEGG通路富集结果显示，差异表达基因主要涉及TNF信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Janus激酶/信号转导与转录激活子信号通路以及RIG‐I受体信号通路等；最后再利用qRT-PCR对差异表达基因进行验证，其结果与转录组学结果基本一致。本研究为进一步研究PEDV感染导致宿主免疫应答变化机制提供了科学依据。
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