【摘 要】
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目的:运用生物信息学方法探究胃癌组织中的差异表达基因(DEGs).方法:从GEO数据库下载数据集并筛选出胃癌DEGs,利用GO和KEGG分析对DEGs进行功能和通路注释,同时使用String数据
【机 构】
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安徽医科大学第一临床医学院,合肥 230000;安徽医科大学第一附属医院胃肠外科,合肥 230000
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目的:运用生物信息学方法探究胃癌组织中的差异表达基因(DEGs).方法:从GEO数据库下载数据集并筛选出胃癌DEGs,利用GO和KEGG分析对DEGs进行功能和通路注释,同时使用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI),筛选出核心基因,结合Kaplan-Meier plotter数据库对筛选出的DEGs进行预后分析.结果:共筛选出2773个DEGs,其中1423个上调,1350个下调.选择COL1A1、COL1A2、BGN等作为10个核心基因并进行预后分析,除COL5A2外,其余基因的上调均影响胃癌患者的总体生存率.结论:COL1A1、COL1A2、BGN等DEGs可能参与胃癌的发生发展,与胃癌患者的预后相关,可以作为胃癌潜在的预测指标和治疗靶点.
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