2011—2015年我国南方地区PEDV分子流行病学调查及S基因遗传变异分析

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应用RT-PCR方法对南方地区五省(广东、广西、福建、四川、江苏)18个猪场7日龄以内发病仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测,对9个猪场进行为期5年的动态监控,并对2011-2015年期间分离的35个PEDV流行株的s基因进行测序,与GenBank中的PEDV参考序列进行比较,并绘制了系统进化树。结果显示,上述地区五省存在Groupl和Group2两种类型毒株。Groupl与美国、韩国毒株较为接近,可分为G1-1、G1-2、G1-3和G1-4等4个亚群,Group2与2004年国
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