土壤中硒、氟、碘元素的空间分异受生物气候、母质和地形控制。受生物气候影响,硒元素在硅铝土区、碳酸盐土区和部分盐渍土区含量较低,铁铝土区尽管含硒量较高,但大部分处于不可给状态,因此缺硒在我国是一个比较广泛的问题;富硒环境由局部地区母质高硒所造成。全氟在土壤中的分异受母质和气候共同影响,西北地区含量低,东南地区含量高;有效性氟则呈现相反的规律,即盐渍土区>碳酸盐土区>硅铝土区>铁铝土区,土壤中碘的含量主要受气候条件影响,有自西北至东南增加的趋势。地形对各元素的分异有重要影响:盐渍土区有效性硒在山前地段富集;有效性氟在地形低洼处富集,或与土壤中碱化作用相伴随。碳酸盐土区和硅铝土区硒、氟都表现为高地淋失,平原、洼地富集的趋势。碘元素在各土壤地球化学区均表现为山地缺乏,低地富集。硒的缺乏与克山病、大骨节病有关。氟的过量和缺乏分别导致氟中毒和龋齿等疾病。碘过多和缺乏都与地方性甲状腺肿有联系。