【摘 要】
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目的 通过生物信息学策略探讨骨质疏松症(OP)与炎症性肠病(IBD)间的基因相关性。方法 分别以“osteoporosis”及“Inflammatory bowel disease”为关键词从网络疾病数据库(DisGeNET、TTD、OMIM、GeneCards)中遴选相关基因,去重后将两组靶基因进行映射得到交集靶点并使用R软件进行GO功能及KEGG通路富集分析,通过string网站分析得到蛋白相
【基金项目】
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湖南省自然科学基金(2022JJ60076); 长沙市科技计划项目(kh2201063);
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目的 通过生物信息学策略探讨骨质疏松症(OP)与炎症性肠病(IBD)间的基因相关性。方法 分别以“osteoporosis”及“Inflammatory bowel disease”为关键词从网络疾病数据库(DisGeNET、TTD、OMIM、GeneCards)中遴选相关基因,去重后将两组靶基因进行映射得到交集靶点并使用R软件进行GO功能及KEGG通路富集分析,通过string网站分析得到蛋白相互作用网络图,通过cytoHubba插件中的MCC算法筛选出关键靶点,借助网络分析工具Networkanalyst预测关联miRNA并绘制网络图。结果 获得OP和IBD相关靶点分别为1779和2779个,获得交集靶点869个,R软件富集得到4278项GO功能富集结果及173条KEGG信号通路,共筛选到10个关键靶点。结论 IL6、IL10、IL17A、TNF、CSF2、IL4、IL1B、CXCL8、IFNG、IL13作用的炎症通路的激活可能是OP与IBD的共同病因,miR-98-5p、miR-335-5p、miR-24-3p和miR-106a-5p可能作为治疗IBD和OP的新手段。
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