目的:在功能性消化不良患者分别采用莫沙必利于与多潘立酮进行治疗,比较分析治疗效果.方法:将2016年2月-2018年3月作为研究时间段,于该时间段中从我院选取100例功能性消化不良患者进行探究分析,随机分成对照组与观察组各50例,将莫沙必利应用到对照组中,将多潘立酮应用到观察组中,对两组患者的治疗效果、不良反应发生情况以及复发率进行比较分析.结果:采取相应的治疗措施后,相较于对照组,治疗总有效率观察组显著较高,其中对照组的治疗总有效率为68％,观察组的治疗总有效率为90％,差异具有统计学意义,差异具有统计学意义(P<0.05);相较于观察组,对照组患者的不良反应发生率明显较高,其中功能性消化不良治疗过程中所产生的不良反应主要可分为口干、轻度稀便、头晕以及的一过性皮疹,对照组中出现不良反应的患者有8例,观察组中出现不良反应的患者有2例,差异具有统计学意义(P<0.05);对照组患者的复发率明显高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05).结论:在功能性消化不良患者中采用多潘立酮的治疗效果显著,降低不良反应发生率的同时降低了复发率,具有较高的安全性,值得临床推广应用.