【摘 要】
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在多种植物中miR169家族成员应答多种非生物胁迫,如高盐,低温和干旱.为了揭示Car-miR169的生物学功能,对Car-miR169家族13个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测.染色体定位结果表明,11个Car-miR169成员分布在鹰嘴豆Ca1、Ca2、Ca4、Ca6和Ca75条染色体上,Car-miR169g和Car-miR1691分别定位在scaffold2734和scaffold362上.Car-miR169a和Car-miR169i在鹰嘴豆Ca1染色体上成簇存在.Car-miR169f
【机 构】
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新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052
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在多种植物中miR169家族成员应答多种非生物胁迫,如高盐,低温和干旱.为了揭示Car-miR169的生物学功能,对Car-miR169家族13个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测.染色体定位结果表明,11个Car-miR169成员分布在鹰嘴豆Ca1、Ca2、Ca4、Ca6和Ca75条染色体上,Car-miR169g和Car-miR1691分别定位在scaffold2734和scaffold362上.Car-miR169a和Car-miR169i在鹰嘴豆Ca1染色体上成簇存在.Car-miR169f和Car-miR169m在鹰嘴豆Ca7染色体上成簇存在.序列比对表明13个Car-miR169成员的成熟miRNA序列一致性为84.28％.13个Car-MIR169成员的前体序列的二级结构分析结果表明,成熟的miRNA序列均位于5\'端,均形成稳定的茎环结构.进化树分析表明,Car-MIR169a、Car-MIR169c、Car-MIR169d、Car-MIR169e、Car-MIR169g与苜蓿的Mtr-MIR169家族亲缘关系较近.Car-MIR169b、Car-MIR169f、Car-MIR169h和大豆Gma-MIR169家族聚在一个分支,Car-MIR169i、Car-MIR169j、Car-MIR169k、Car-MIR1691和水稻Os-MIR169a聚在一个分支,而Car-MIR169m单独为一个分支.靶基因预测表明大部分Car-miR169家族成员的靶基因为核转录因子A亚基.鹰嘴豆8个组织的转录组数据分析表明Car-miR169i、Car-miR169j、Car-miR169k、Car-miR1691在叶、茎、花蕾、花和豆荚中不表达,Car-miR169e在茎中不表达,其他成员在8个组织中均表达.这些研究结果为研究鹰嘴豆Car-miR169家族成员及其靶基因的功能提供了基础.
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