生物信息学方法筛选鼻咽癌的7个关键基因

来源 :武汉大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:shenglove5
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目的:通过基因芯片技术及生物信息学方法筛选鼻咽癌的7个关键基因,帮助了解鼻咽癌的发生发展的分子机制.方法:通过差异基因分析、加权共表达基因的构建以及蛋白互作网络的分析筛选出与鼻咽癌显著相关的基因.结果:经过对基因组GSE12452的差异基因分析得出838个差异基因,将该结果纳入另一数据集GSE13597中构建加权基因共表达网络,最后分析蛋白互作网络,综合两者的结论得出7个相关性最显著的核心基因.结论:本研究为鼻咽癌提供了更多的潜在生物标记物,对鼻咽癌发生发展的分子机制提供了有效指导.
其他文献
目的:探讨金属硫蛋白(MT)家族在膀胱癌中的免疫调节功能及临床价值.方法:应用GEPIA和UALCAN数据库筛选金属硫蛋白家族在膀胱癌中与正常组织存在表达差异及与总体生存期显著相关的基因;利用TIMER和TISIDB数据库探讨MT1L在膀胱癌中的免疫调节功能,使用逻辑回归和多因素Cox回归分析探讨了MT1L在膀胱癌中的预后价值;应用GSEA数据库分析了在膀胱癌中MT1L可能的生物学功能.结果:两个数据库一致显示,金属硫蛋白家族中只有MT1L在膀胱癌组织与正常组织之间存在显著的表达差异,并与总体生存期显著相