【摘 要】
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目的选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料。方法根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲
【机 构】
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云南省第一人民医院呼吸内科,云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所
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目的选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料。方法根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina Hi Seq2500进行paired-end测序。对测序结果进行拼接、组装以及注释等。结果基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒。YN2011004的1号染色体具有2 727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1 948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2 653个基因,2号染色体具有907个基因。所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面。结论云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒。
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