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在新形势下成立的疾病预防控制中心科研工作存在以下薄弱环节：（1）重视疾病防治任务而忽略科研工作；（2）重视现场人群研究而忽略与实验室研究相结合；（3）科研工作以应用型研究为主而缺乏基础性研究；（4）卫生防病人员不善于总结和发掘日常卫生实践经验。疾病预防控制中心的科研管理人员必须充分认识这些问题，通过强化科研管理工作及时解决这些问题，以科研促发展，提高疾病预防控制活动的技术含量，满足新形势下人民群众对疾病预防和控制服务的需求及疾控体系自身发展的需要。