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目的
以CLSI-MM18A(病原菌DNA测序鉴定的解释指南)推荐的RPOB(利福平耐药)基因为参考标准,评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对非结核分枝杆菌的鉴定和分型的水平的能力。
方法收集2012年至2016年从临床分离的不同感染部位的55株NTM菌株,利用RPOB进行管家基因测序,并对测序结果进行系统发育进化分析;同时利用MALDI-TOF MS技术对菌株进行鉴定,并对蛋白指纹图谱进行聚类分析;评价两种方法对NTM鉴定和分型的一致性。
结果RPOB基因对55株NTM显示了很好的鉴定(测序结果TM值均大于99%)和分型(可区分到复合群内的种或亚种)能力;法国BioMerieux MALDI-TOF MS技术对55株NTM的鉴定到属的水平为89.1%,鉴定到种的水平为78.2%,鉴定水平良好;利用SARAMS Premium软件对蛋白指纹图谱的聚类分析也显示出了良好的分型能力。
结论MALDI-TOF MS技术可以有效的对非结核分枝杆菌进行鉴定和分型,其检测周期短,操作简便,在实验室中与RPOB基因联合应用有着很好的互补性。(中华检验医学杂志,2018, 41:109-115)