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喀纳斯自然保护区自建立以来，已有近20年的历史，其先后完成保护区“一期”和“二期”工程建设。经过两期建设，保护区在局站址建设、保护工程、科研监测、宣传教育及基础设施设备等方面已经具有一定基础，基本能满足管理工作的需要，由于保护区资源本底不清，加之缺乏有效投资，喀纳斯国家级自然保护区科研监测体系建设处于初级阶段。