新型冠状病毒关键受体ACE2基因启动子的生物信息学分析

来源 :湖南师范大学自然科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xuliyong

【摘要】

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为探究新型冠状病毒(SARS-CoV-2)关键受体ACE2基因的启动子、CpG岛、转录因子以及SNP位点,从GeneBank数据库获取人ACE2基因组序列和其在染色体的定位信息,并且利用多种生物信

【作者】

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王道刘丹

【机构】

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中南大学湘雅二医院妇产科

【出处】

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湖南师范大学自然科学学报

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

：

ACE2基因启动子 5′调控区生物信息学 ACE2 genepromoter5′regulatory regionbioinformatics

【基金项目】

：

湖南省自然科学青年基金项目(2017JJ3436)

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为探究新型冠状病毒(SARS-CoV-2)关键受体ACE2基因的启动子、CpG岛、转录因子以及SNP位点,从GeneBank数据库获取人ACE2基因组序列和其在染色体的定位信息,并且利用多种生物信息学工具对其上游5′端的启动子、转录因子结合位点、CpG岛、SNP等进行预测和分析。结果表明,人ACE2基因5′调控区2100 bp区域含启动子序列;Promoter 2.0和NNPP数据库推测其区间分别存在1个、2个启动子;AliBaba 2.1和PROMO数据库预测到其启动子保守区域共同的转录因子结合位点为2

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