转录组解析外源ABA对玉米脱水速率的影响

来源 :华北农学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hedongxu2288

【摘要】

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为了探明迪卡517、郑单1002喷施外源ABA后脱水速率变化的分子机制,发掘影响脱水速率的关键差异表达基因及代谢通路,利用Illumina HiSeqTM2500测序仪分别对喷施ABA前后迪卡517

【作者】

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李川黄璐张美微张盼盼刘京宝牛军乔江方

【机构】

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河南省农业科学院粮食作物研究所

【出处】

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华北农学报

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

玉米穗位叶外源ABA 高通量转录组测序差异表达基因脱水速率 MaizeEar leafExogenous abscisic acid(ABA)Illum

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(31701368),河南省农业科学院优青项目(2020YQ03),“十三五”国家重点研发计划项目(2018YFD0300702,2017YFD0301102,2018YFD0200605),河南省农业科学院自主创新项目

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为了探明迪卡517、郑单1002喷施外源ABA后脱水速率变化的分子机制,发掘影响脱水速率的关键差异表达基因及代谢通路,利用Illumina HiSeqTM2500测序仪分别对喷施ABA前后迪卡517(脱水速率较快)和郑单1002(脱水速率较慢)的穗位叶进行高通量转录组测序。原始序列经过质量控制、基因组比对、测序饱和度、基因覆盖度及冗余序列分析后进行基因功能注释。结果显示,迪卡517外源ABA处理与正常生长条件对比组检测到1732个差异表达基因,其中1251个为上调表达基因,481个为下调表达基因;郑单10

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