目的对贵州省织金县一起疑似皮肤炭疽疫情来源标本进行病原体分离鉴定和基因分型,了解菌株的分子流行病学特征,为疫情判定提供病原学依据。方法对患者皮肤渗出液、血液及病死牛刨剐地土壤进行炭疽芽胞杆菌分离鉴定,采用Real-time PCR检测炭疽芽胞杆菌Pag A、Cap及rpo B基因,进一步采用基于15个串联重复序列(Variable number tandem repeat,VNTR)的多位点可变数量串联重复序列分析(Multiple locus VNTRs analysis,MLVA-15)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)技术对炭疽芽胞杆菌进行分子分型。结果从本次疫情中患者皮肤渗出液和血液各分离出1株疑似炭疽菌株,传统方法将2株分离菌株鉴定为炭疽芽胞杆菌,土壤标本未分离到炭疽菌。2株菌Pag A、Cap和rpo B阳性,其15个VNTR位点的重复次数谱型均为9-20-12-53-16-2-8-8-8-4-4-4-4-10-4,SNP结果显示2株菌同属A.Br.001/002簇。结论从本次疫情患者皮肤渗出液和血液检出具有致病基因的炭疽芽胞杆菌,2株菌的MLVA-15和SNP型别特征一致,提示该起疫情为感染炭疽芽胞杆菌所致。