基于伪氨基酸和支持向量机的蛋白质亚细胞定位预测

来源 :广西农业生物科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:icenum123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
用电子-离子伪势能(EIIP)对蛋白质序列数字化,经离散傅立叶变换(DFT)后,取5个最高幅值对应的频率和20种氨基酸在序列中所占的百分比组成伪氨基酸。用支持向量机(SVM)方法得到分类的模型,并用几个标准的测试方法测试模型的性能。自身一致性测试和Jackknife测试均取得高的预测准确率,独立数据集测试的准确率超过80%。和之前报道的方法相比,本方法具有较高的预测准确率。
其他文献
目的评估戴西斯R/S2003尿沉渣定量分析工作站(下称工作站)的性能及临床应用价值.方法用新鲜尿配制红细胞理论值5个量级单位,作准确性检定.用双盲法对同一标本的有形成份重复
1 公立医院人事制度改革的必要性1.1 公立医院普遍存在的活力不足,工作效率低,服务质量不尽人意等问题,从根本上影响了医院的可持续发展近年来,随着城镇医疗卫生体制改革的深
利用农杆菌侵染法获得抗软腐病转BrWRKY33基因大白菜,首先要构建植物表达载体。本实验根据BrWRKY33基因的序列及pROK2表达载体的酶切位点设计引物(FN/RN),获得BrWRKY33基因,