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淡水海绵的最早记录是1758年Linneaus所发现并命名的河轮海绵和湖针海绵,世界各地目前已发现淡水海绵225种。形态学分类方法一直是淡水海绵分类研究中主要的方法,分子手段分类方法还未得到确认。淡水海绵为雌雄同体,但有些种存在性别可变性。芽球为淡水海绵的重要特征结构,在淡水海绵的无性生殖过程中有重要的作用。淡水海绵可作为指示生物帮助监测水体的质量。中国现有淡水海绵分为1科（针海绵科Spongillidae）9属26种。