教育系统是较早开展经济责任审计的行业，国家教育部及各级教育行政主管部门对经济责任审计工作非常重视。教育系统内部审计，特别是高校内部审计，无论在机构设置还是人员配备上，都比较完善。教育审计已经成为国家审计监督体系的重要组成部分，高校内部审计更是教育系统审计的主要力量。近几年来，按照中办、国办《党政主要领导干部和国有企业领导人员经济责任审计规定》（中办发[2010]32号）、审计署《关于印发深化经济责任审计工作指导意见的通知》（审经责发[2011]122号）和教育部《关于做好教育系统经济责任审计工作的通知》（教财[2011]2号）要求，国家各级教育行政管理部门都能积极的开展属高校校长离任经济责任审计和任期经济责任审计（届满连任），高校也能深入推进二级学院院长、行政机关负责人、附属医院院长和学校产业集团负责人的离任经济责任审计工作。高校经济责任审计在加强领导干部监督、维护财经纪律、防范财务风险、推进依法治校等方面取得了积极的成效，充分发挥了经济责任审计的“免疫系统”功能。但按照有关规定，“坚持任中审计与离任审计相结合，不断加强任中审计比重，不断建立和完善领导干部任期内轮审制度”的要求，绝大部分教育行政管理部门和高校都没能开展任中经济责任审计工作，本文在分析高校任中经济责任审计的作用和实施现状的基础上，对如何开展任中审计进行分析，展望任中经济责任审计未来的发展。