【摘 要】
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目的 克隆人类肥胖相关新基因LYRM1,并对其进行初步的牛物信息学分析.方法 以人网膜脂肪组织为模板,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术从人网膜脂肪组织中分离LYRM1基因的
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目的 克隆人类肥胖相关新基因LYRM1,并对其进行初步的牛物信息学分析.方法 以人网膜脂肪组织为模板,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术从人网膜脂肪组织中分离LYRM1基因的完整编码框,并将其克隆到TA克隆载体,RT-PCR法鉴定并测序.利用一系列牛物信息学软件或数据库初步分析预测LYRM1基因及其编码蛋白的基因结构、染色体定位、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等.结果 扩增出包含LYRMI基因开放阅读框的cDNA片段,采用RT-PCR及测序方法证实成功克隆出目的 片段.生物信息学分析显示,LYRM1基因cDNA全长1 589 bp,开放阅读框长369 bp,编码122个氨基酸,相对分子质量13 270;定位于染色体16p11.2区域,含4个外显子和3个内含子.蛋白序列分析显示LYRM1基因编码蛋白无跨膜螺旋结构,为一非分泌蛋白.亚细胞定位分析提示其定位于胞核的可能性较大,蛋白结构域分析提示N端存在-LYR结构域,可能参与线粒体功能及能量代谢.蛋白序列比对提示LYRM1基因编码蛋白相对保守.结论 LYRM1基因的成功克隆及生物信息学分析为进一步研究该基凶奠定了基础.实用儿科临床杂志,2009,24(19):1470-1473
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