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[目的]研究从DNA碱基序列水平检测金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）的方法。[方法]根据金黄色葡萄球菌凝固酶基因设计扩增引物和测序引物，先用PCR特异性地扩增目的片段，再制备单链模板，在测序引物引导下用焦磷酸测序法检测DNA碱基序列，检测的DNA碱基序列为GCCTGTGGGTACT—TCTCCTGCCAGTATAAT，则判断为金黄色葡萄球菌。[结果]20株金黄色葡萄球菌均扩增出大小215bp的DNA片段，而其他对照菌株未扩增出DNA条带。焦磷酸测序结果，20株金黄色葡萄球菌均测