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番茄果实富含的次生物质严重干扰其总RNA的提取，本试验采用4种方法对番茄果实总RNA进行提取，筛选出一种适合于番茄后续的cDNA-扩增片段长度多态性（amplifiedfragmentlengthpolymorphism，AFLP）分析的高质量RNA提取方法，该方法排除了蛋白、多糖、以及多酚等次生物质的干扰，总RNA得率高、完整性好、纯度高。通过cDNAAFLP分析方法的检测，得到了一组条带清晰和多态性丰富的图谱。