【摘 要】
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为分析LSm1基因的特点,预测其编码蛋白的生物学功能,试验利用巢式PCR方法对Marc145细胞源LSm1基因进行扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学方法对Marc145细胞源LSm1基因进行
【机 构】
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贵州大学动物科学学院,贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵州大学大数据与信息工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金:P-body在PRRSV复制和持续感染过程中的作用机制研究(国科金计项[2014]44),贵州省科学技术基金:NSP2亚类在PRRSV复制过程中的作用机制研究(黔科合J字[2015]2046号)
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为分析LSm1基因的特点,预测其编码蛋白的生物学功能,试验利用巢式PCR方法对Marc145细胞源LSm1基因进行扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学方法对Marc145细胞源LSm1基因进行序列分析,并对其编码蛋白进行二级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,经过两轮的PCR扩增,成功获得402bp的Marc145细胞源LSm1基因,编码133个氨基酸。Marc145细胞源LSm1基因核苷酸序列与人类、灵长类同源性较高,其次是海洋哺乳动物类,最后是陆地野生动物及家畜,同源性为9
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