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氨基酸序列自动分析仪大大提高了氨基酸序列分析的速度,但碰到的问题是供分析用的蛋白质样品的纯度不易掌握,常常半途中断分析过程。以ABI 470A/900A机为例,每设置10~15个氨基酸的分析,在许多情况下只分析到一半或多一些即被中断。该机为ODS-C18反相柱型,经化学处理的逐个氨基酸按各自在该柱的保留时间被仪器区分开并记录下来。我们选用此机型来分析工程菌产霍乱毒素B亚单位(rBS)。由于我们的rBS是新型口服霍乱疫苗的成分之一,国家药政部门要求分析N端20个氨基酸