【摘 要】
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目的 探讨肌动蛋白结合蛋白(Fscn)1基因在非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织和癌旁组织中的表达及意义.方法 采用生物信息分析方法分析人类肿瘤基因组(TCGA)数据库中Fscn1基因的表达情况.在STRING数据库中建立Fscn1基因及其相关蛋白互相作用网络,对网络中的蛋白进行功能富集.采用生存分析探讨Fscn1基因高低表达水平与NSCLC患者的预后关系.同时回顾性分析NSCLC患者51例,采用免疫组织化学法检测手术标本中NSCLC患者癌组织和癌旁正常组织中Fscn1基因编码蛋白表达水平,分析比较Fs
【机 构】
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天津市泰达医院呼吸内科,天津 300457;天津市泰达医院神经外科,天津 300457;天津医科大学总医院神经外科;天津大学海河医院呼吸与危重症医学科
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目的 探讨肌动蛋白结合蛋白(Fscn)1基因在非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织和癌旁组织中的表达及意义.方法 采用生物信息分析方法分析人类肿瘤基因组(TCGA)数据库中Fscn1基因的表达情况.在STRING数据库中建立Fscn1基因及其相关蛋白互相作用网络,对网络中的蛋白进行功能富集.采用生存分析探讨Fscn1基因高低表达水平与NSCLC患者的预后关系.同时回顾性分析NSCLC患者51例,采用免疫组织化学法检测手术标本中NSCLC患者癌组织和癌旁正常组织中Fscn1基因编码蛋白表达水平,分析比较Fscn1基因编码蛋白表达与患者临床病理特征的关系.结果 Fscn1基因在多种肿瘤中表达水明显高于对应的癌旁组织,且在NSCLC患者中Fscn1基因mRNA表达水平明显上调(P<0.05).与Fscn1基因相互作用较为紧密的蛋白网络共有节点数共51个,相互作用关系446个,区域聚类指数为0.75,蛋白相互作用网络富集显著(P<0.05).Fscn1基因及其相关蛋白功能主要富集于蛋白相互连接.Fscn1基因正相关表达最显著的基因为SPHK1基因(r=0.53);与Fscn1基因负相关表达最显著的基因为跨膜蛋白(TMEM)125(r=-0.38).生存分析显示高低表达组总生存(HR=1.3,P0.05).进一步根据病理类型分为鳞癌和腺癌,结果显示肺腺癌中,Fscn1基因mRNA高表达患者总生存期显著低于低表达者(HR=1.6,P<0.05).Fscn1基因编码蛋白在NSCLC患者癌和癌旁组织中的阳性表达率分别为70.6％(36/51)和17.6％(9/51).Fscn1基因编码蛋白在NSCLC患者癌组织中的阳性表达率显著高于癌旁组织(P<0.05).Fscn1基因编码蛋白在癌组织中的阳性表达与NSCLC患者的临床分期(P<0.05)和纵隔淋巴结转移有关(P<0.05).结论 Fscn1基因在NSCLC患者肿瘤组织中表达明显上调,且可能参与了肺癌的转移过程.通过靶向一致Fscn1基因表达,有望成为NSCLC治疗的新靶点.
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