【摘 要】
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块菌是重要的经济真菌,在其生长发育过程中,细菌扮演了重要角色。本文利用传统分离培养方法和高通量测序技术分析了印度块菌(Tuber indicum)子囊果内细菌的群落结构。共分离
【机 构】
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北方民族大学生物科学与工程学院; 中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室;
【基金项目】
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北方民族大学重点科研项目(2017KJ27)
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块菌是重要的经济真菌,在其生长发育过程中,细菌扮演了重要角色。本文利用传统分离培养方法和高通量测序技术分析了印度块菌(Tuber indicum)子囊果内细菌的群落结构。共分离得到细菌532株,根据物种累积曲线,选取其中的112株细菌进行了16SrRNA基因序列分析,共鉴定出4属40种,其中假单胞菌属(Pseudomonas)菌株占所测菌株数的80%,不动杆菌属(Acinetobacter)占12.5%,链霉菌属(Streptomyces)占5%,贪噬菌属(Variovorax)占2.5%。通过对印度块菌子囊果16Sr RNA基因的V1–V3区高通量测序分析,共获得细菌序列9,862条,分属于7门43属220种,其中变形菌门、拟杆菌门和放线菌门的物种占总物种数的99.7%,是印度块菌子囊果内的优势细菌。黄杆菌属(Flavobacterium)、壤霉菌属(Agromyces)、微杆菌属(Microbacterium)、剑菌属(Ensifer)和寡养食单胞菌属(Stenotrophomonas)的物种数占总物种的86.3%,是印度块菌子囊果内细菌的优势属。研究结果表明,采用胰蛋白大豆培养基仅分离得到印度块菌子囊果内少数细菌物种,而采用高通量测序技术分析发现,印度块菌子囊果内细菌物种种类丰富,群落结构复杂。
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