目的探讨不同型肠道病毒感染手足口病儿童的病毒临床特点。方法选取2015年1月-2016年6月在医院儿科住院治疗且确诊为手足口病的患儿162例,根据感染病毒不同将其分为CoxA16组91例和EV71组71例,比较两组患儿入院时病毒载量、临床特点、生命体征指标,手、足部皮疹以及口腔疱疹分布。结果循环阈值EV71组为(27.6±3.9),CoxA16组为(25.7±3.7),EV71组循环阈值显著高于CoxA16组,且差异有统计学意义(P<0.05);EV71组患儿的病程、热程均长于CoxA16组,EV71组患儿伴随咳嗽比例显著低于CoxA16组,EV71组患儿伴随嗜睡、惊厥、呕吐、肌肉痉挛比例显著高于CoxA16组,且差异有统计学意义(P<0.05);EV71组患儿最高体温、最高收缩压、最高舒张压、最快心率、最快呼吸频率以及外周血白细胞计数均显著高于CoxA16组患儿,且差异有统计学意义(P<0.05);EV71组患儿上腭、咽峡部、颊粘膜发生口腔溃疡比例显著低于CoxA16组,且差异有统计学意义(P<0.05)。结论肠道病毒感染手足口病儿童的病毒载量与病毒的型别有关,EV71型病毒性手足口病不易被察觉,易发生嗜睡、惊厥、呕吐、肌肉痉挛,且生命体征较差,CoxA16型病毒性手足口病易发生咳嗽,口腔溃疡,在临床治疗是一定要区分对待,对控制患儿的病情具有重要意义。