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在首都医科大学“整合临床”的指导思想下,2006年首都医科大学传染病学系以首都医科大学附属北京佑安医院作为牵头单位,联合首都医科大学基础医学院病原生物学系、首都医科大学附属北京友谊医院热带病研究所、北京市疾病预防控制中心传染病地方性疾病控制所及首都医科大学各附属医院相关科室及专家共同组建。