2009-2018年湖南省甲型H1N1亚型流感病毒监测结果及其全基因组进化分析

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目的分析2009—2018年湖南省流感哨点医院甲型H1N1亚型流感监测结果,对分离病毒全基因组进化情况和分子特征进行分析。方法在全省14个市州的23家哨点医院开展流感监测工作,每周每家哨点医院门诊采集5~20份流感样病例的咽拭子标本进行核酸检测和/或病毒分离。对分离的毒株全基因测序,使用BEAST软件贝叶斯方法构建基因进化树,序列与疫苗株进行比较。结果 2009—2018年湖南省流感监测哨点医院共采集流感样病例标本190 289份,其中甲型H1N1流感阳性8 014份,阳性率为4.21%。时间分布共有7个较明显的流行高峰,峰值以2009年最高。1~5岁(占25.13%)和5~15岁(占32.83%)年龄组所占比重较多,人群男女性别比为1.23∶1。对分离的60株甲型H1N1亚型流感病毒进行同源性分析,与疫苗株相比全基因组序列的同源性在97.2%~99.9%之间。贝叶斯基因进化树呈现阶梯状生长。推断最早的公共祖先出现在2 009.177年,平均进化速率为2.695×10-3个替换·位点-1·年-1。贝叶斯天际线模型分析甲型H1N1流感的种群动态2009—2018年间基本维持稳定。表面蛋白选择压力分析dN/dS值为0.201与0.219。表面蛋白血凝素分子的主要变异位点为L8M、S91R、S160G、S181T、A214T、I312V。2株病毒神经氨酸酶分子出现H275Y耐药位点的突变。结论 2009—2018年湖南省每年甲型H1N1流感阳性率和甲型H1N1流感所占流感比例各不相同,流行高峰出现在冬季,病例以儿童和少年为主,病毒基因持续变异,种群动态稳定。
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