草菇菌丝体与原基差异表达基因分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jian47312144

【摘要】

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采用Solexa测序技术,对草菇菌丝体和原基进行了数字基因表达谱（DGE）测序,在菌丝体和原基文库中分别得到5701781个和5659262个高质量测序标签（cleantags）,对应的标签种数（distinct

【作者】

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刘朋虎邓优锦江玉姬谢宝贵王海英章小寅

【机构】

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福建农林大学菌物研究中心

【出处】

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基因组学与应用生物学

【发表日期】

：

2012年2期

【关键词】

：

草菇子实体形成数字基因表达谱差异表达基因 Fruit body formation Volvariella volvacea Digital gene e

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采用Solexa测序技术,对草菇菌丝体和原基进行了数字基因表达谱（DGE）测序,在菌丝体和原基文库中分别得到5701781个和5659262个高质量测序标签（cleantags）,对应的标签种数（distinct clean tags）分别为85626和95363。将所有高质量测序标签与参考基因库进行比对,在菌丝体和原基文库中,占标签种数的43.32%和52.57%的标签可以唯一定位（map）到参考序列上,占标签种数的21.65%和21.47%的标签可以被定位到基因组序列上。最终,被菌丝体和原基标签唯一定

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